کتابخانه مرکز آموزشی درمانی امام خمینی (ره) خوی در سال 1398 با زیربنای مفید 12 متر مربع در طبقه اول ساختمان بیمارستان با 290 نسخه کتاب افتتاح گردید و در سال 1400 زیر بنای مفید آن  100متر مربع در طبقه همکف ساختمان اصلی این مرکز تغییر یافت. سپس در سال 1401 زیربنای ساختمان به 185 متر مربع ارتقا یافته و محل آن به طبقه همکف ساختمان کلینیک تخصصی تغییر یافت.

این کتابخانه دارای بخش امانت، مخزن کتاب و سایت کتابخانه و سالن مطالعه بوده و مجموعه کتابخانه دارای امکانات مناسب گرمایشی و سرمایشی است. کتابخانه بیمارستان امام خمینی از نرم افزار جامع کتابخانه آذرسا بهره می برد، جستجو و اطلاع رسانی منابع از طریق اینترنت و سایت دانشگاه و نیز لینک بانکها و پایگاههای اطلاعاتی تخصصی پزشکی امکان پذیر است. سیستم کتابخانه به منظور تحقق فلسفه استفاده حداکثری از منابع، تشویق و افزایش انگیزه کتابخوانی بصورت قفسه باز بوده و دانشجویان و مراجعین علاوه بر راهنمایی کتابداران و استفاده از نرم افزار کتابخانه برای جستجوی منابع بصورت مراجعه مستقیم به مخزن نیز می توانند منابع مورد نظر خود را انتخاب نمایند.